Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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