Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Trappc1Q5NCF2 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms