Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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