Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpusd3Q14AI6 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms