Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Thbs3Q05895 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Thbs3Q05895 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Thbs3Q05895 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Thbs3Q05895 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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