| Hoxd1 | Q01822 | Gm24191-201 | ENSMUST00000157977 | 122 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26041-201 | ENSMUST00000158148 | 108 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23542-201 | ENSMUST00000158208 | 96 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22891-201 | ENSMUST00000158641 | 164 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7097-201 | ENSMUST00000161841 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm3027-201 | ENSMUST00000167579 | 451 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm10772-201 | ENSMUST00000167981 | 255 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm3104-201 | ENSMUST00000171004 | 473 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm22951-201 | ENSMUST00000179471 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42832-201 | ENSMUST00000196361 | 745 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm43405-201 | ENSMUST00000198642 | 337 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir691-201 | ENSMUST00000199719 | 78 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44055-201 | ENSMUST00000204376 | 247 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44438-201 | ENSMUST00000204388 | 3236 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm36445-205 | ENSMUST00000211729 | 1100 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1168-202 | ENSMUST00000215996 | 2322 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC167229.1-201 | ENSMUST00000220057 | 469 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1700112M02Rik-201 | ENSMUST00000221719 | 348 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC160115.1-201 | ENSMUST00000224678 | 1574 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr746-201 | ENSMUST00000080616 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26164-201 | ENSMUST00000083793 | 104 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm5416-201 | ENSMUST00000089628 | 294 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1340-201 | ENSMUST00000094834 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1211-204 | ENSMUST00000215205 | 4220 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1039-202 | ENSMUST00000214364 | 3925 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r66-205 | ENSMUST00000228622 | 3304 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr913-201 | ENSMUST00000081095 | 2441 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Wac-217 | ENSMUST00000172018 | 1965 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp493-201 | ENSMUST00000164936 | 3258 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AI504432-201 | ENSMUST00000070085 | 5569 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Spata31-201 | ENSMUST00000070216 | 3232 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr807-203 | ENSMUST00000217106 | 1788 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mier1-201 | ENSMUST00000030247 | 4703 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr652-202 | ENSMUST00000215410 | 4672 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr138-203 | ENSMUST00000173841 | 1865 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Dst-211 | ENSMUST00000183034 | 23201 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr392-201 | ENSMUST00000118463 | 3643 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr748-202 | ENSMUST00000213101 | 3632 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r178-203 | ENSMUST00000226489 | 2644 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Tcrg-V5-201 | ENSMUST00000103556 | 293 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24890-201 | ENSMUST00000104389 | 102 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12782-201 | ENSMUST00000117519 | 727 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rpl31-ps5-201 | ENSMUST00000118086 | 375 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm15026-201 | ENSMUST00000119219 | 458 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25438-201 | ENSMUST00000158281 | 110 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rpl30-ps2-201 | ENSMUST00000160070 | 291 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm20484-201 | ENSMUST00000173738 | 231 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir5624-201 | ENSMUST00000176635 | 61 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir6385-201 | ENSMUST00000184295 | 105 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm8242-202 | ENSMUST00000193056 | 475 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42468-201 | ENSMUST00000200360 | 703 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr515-ps1-201 | ENSMUST00000208389 | 189 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | CT030247.1-201 | ENSMUST00000216810 | 267 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC130222.1-201 | ENSMUST00000221198 | 256 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm9818-201 | ENSMUST00000050900 | 255 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm10237-201 | ENSMUST00000078393 | 273 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25207-201 | ENSMUST00000093745 | 107 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14387-201 | ENSMUST00000121827 | 2055 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm31592-201 | ENSMUST00000217529 | 3471 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mcmdc2-203 | ENSMUST00000125294 | 2003 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Arhgef6-202 | ENSMUST00000114735 | 1614 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37879-201 | ENSMUST00000193112 | 1995 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42524-201 | ENSMUST00000202881 | 2214 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24987-201 | ENSMUST00000104453 | 134 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm5762-201 | ENSMUST00000119204 | 258 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm15037-201 | ENSMUST00000120358 | 259 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13153-201 | ENSMUST00000120969 | 637 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Nectin3-206 | ENSMUST00000121803 | 541 nt | TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13901-201 | ENSMUST00000137252 | 468 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22843-201 | ENSMUST00000157710 | 134 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24998-201 | ENSMUST00000157908 | 89 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28148-201 | ENSMUST00000186924 | 697 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43355-201 | ENSMUST00000196541 | 346 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43393-201 | ENSMUST00000200147 | 194 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44355-201 | ENSMUST00000200417 | 104 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7652-201 | ENSMUST00000200440 | 1151 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43812-201 | ENSMUST00000200976 | 581 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm18423-201 | ENSMUST00000205144 | 1074 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm45368-202 | ENSMUST00000210944 | 416 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm45778-201 | ENSMUST00000211959 | 153 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | CT572985.2-201 | ENSMUST00000220496 | 211 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC124729.1-201 | ENSMUST00000225327 | 976 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22061-201 | ENSMUST00000082557 | 107 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25801-201 | ENSMUST00000082638 | 106 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr713-202 | ENSMUST00000213623 | 6329 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42585-201 | ENSMUST00000198731 | 4020 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr104-ps-202 | ENSMUST00000215398 | 2771 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29221-201 | ENSMUST00000186092 | 2894 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Samd9l-201 | ENSMUST00000120087 | 5330 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r178-204 | ENSMUST00000226640 | 2282 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Wfdc18-201 | ENSMUST00000001009 | 521 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22488-201 | ENSMUST00000116811 | 127 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r-ps125-201 | ENSMUST00000117767 | 290 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm11253-201 | ENSMUST00000118486 | 201 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12954-201 | ENSMUST00000118610 | 611 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Defb44-ps-201 | ENSMUST00000126871 | 219 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Cdrt4os2-201 | ENSMUST00000128675 | 494 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1234-203 | ENSMUST00000137692 | 3827 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |