Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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