Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms