Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RxraP28700 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RxraP28700 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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