Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd12P23812 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms