Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DffaO54786 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms