Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms