Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Spocd1B1ASB6 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms