Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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