Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Limd1Q9QXD8 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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