Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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