Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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