Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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