Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube2cQ9D1C1 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms