Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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