Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm5Q9CXE0 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms