Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms