Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn16Q925N4 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn16Q925N4 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn16Q925N4 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn16Q925N4 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn16Q925N4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn16Q925N4 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn16Q925N4 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms