Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NipblQ6KCD5 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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