Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp4Q68FH0 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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