Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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