Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ttf2Q5NC05 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ttf2Q5NC05 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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Ttf2Q5NC05 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ttf2Q5NC05 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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