Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Puf60Q3UEB3 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms