Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms