Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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ptchd1Q14B62 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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