Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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Sh3bp2Q06649 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp2Q06649 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms