Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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