Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms