Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DffaO54786 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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