Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms