Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn34c3J3QJW5 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34c3J3QJW5 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms