Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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