Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn12Q9ET43 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms