Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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