Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccdc39Q9D5Y1 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc39Q9D5Y1 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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