Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Zbed3Q9D0L1 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Zbed3Q9D0L1 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms