Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc47Q9D024 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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