Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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