Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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