Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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Ctu1Q99J10 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Ctu1Q99J10 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Ctu1Q99J10 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Ctu1Q99J10 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctu1Q99J10 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms