Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.3 ms