Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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