Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NipblQ6KCD5 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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