Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Pkp4Q68FH0 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pkp4Q68FH0 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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