Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxa13Q62424 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Hoxa13Q62424 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxa13Q62424 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms