Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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